Адаптер адаптор

Адаптер, адаптор * адаптар * adapter or adaptor — 1. Одноидидвунитевые олигонуклеотиды, предназначенные для объединения молекул с несоместимыми концами. У дуплексов концы разные: один конец ровный, а другой — ступенчатый, либо оба конца ступенчатые. Адаптеры применяют, когда концы векторных и клонируемых молекул образованы различными рестриктазами, а также когда в клонируемых фрагментах ДНК есть сайты используемых рестриктаз. Однонитевые А. используют для объединения молекул с 51 и 31-выступающими концами. Напр., концы, образованные рестриктазами EcoRI и Hhal, состыковывают с помощью EcoRIHhal А. Возникающие при этом пробелы (бреши) в двунитевой структуре ДНК заполняются нуклеотидными остатками in vivo после трансформации. В готовом виде имеются лишь однонитевые линкеры и адап теры, причем фирмы предлагают также варианты с дефосфорилированными 51-концами. Последние используют для предотвращения их самолигирования в опытах по клонированию. Двунитевые А. при необходимости получают комбинацией а) двух однонитевых А., б) двух линкеров, в) адаптера и линкера. Двунитевые А. с различными выступающими концами способны изменять выступающие концы ДНК. Такие А. называют конверсионными. Примером такого А. является адаптер EcoRI-BamHI, с помощью которого BamHI-концы можно заменить EcoRI-концами и интегрировать модифицированные таким образом фрагменты ДНК в EcoRI-сайты векторов. Иногда сайты узнавания для рестриктаз, используемых при внедрении фрагментов в вектор, располагаются внутри этого фрагмента. В таких случаях данный фрагмент вырезают с помощью других рестриктаз, для чего на его концах создают соответствующие сайты узнавания. Для этих целей используют А., содержащие такие сайты. Напр., если BamHI-адаптер использовался для встраивания фрагмента ДНК, у которого ровные концы и внутри имется BamHIсайт, в такой же сайт вектора, то его можно вырезать из рекомбинационной ДНК с помощью рестриктазы SmaI. 2. Короткий синтетический олигонуклеотид с одним тупым и другим липким концом. Тупые концы (см.) олигонуклеотидов лигируются (см. Лигирование) с тупыми концами фрагмента ДНК. Такой фрагмент ДНК, имея два липких конца (см. Липкий конец), может быть присоединен к нужному вектору путем соединения оснований на липких концах с помощью фермента лигазы (см.).